生化妊娠是指精子和卵子已经在输卵管里结合成为了受精卵，受精卵一面生长发育一面向子宫腔移动，大约6～8天左右受精卵来到营养丰富的子宫内膜着床，然后7～10天左右胎盘开始分泌hcg，通过血液循环进入尿液。这个时候用早孕试纸就可以检测到了。
生化妊娠就是精卵虽然结合了，但是迷路了没有回到子宫里着床，或者是回来了没有着上床就已经凋亡，医学上就称为生化妊娠，其实是一种隐性流产。
造成生化妊娠最常见的原因是胚胎遗传物质异常，占到所有生化妊娠病因的一半左右。通常是卵子或精子在形成的过程中，或者在结合的过程中，发生遗传物质不均匀分配造成的。其次就是母体存在一些潜在的疾病没有发现，比如免疫系统疾病、易栓症等，这类疾病的特点是平时不会有不舒服的感觉，也没有临床症状，但是只要怀孕了极易发生早孕期流产。
发生生化妊娠一般都是怀孕5周左右，血清中的激素（hcg）水平升高，但是，在超声检查的时候，没有发现宫腔内有妊娠囊存在。
虽然激素（hcg）水平升高，但是很有限，一般只有-左右，孕酮水平也是偏低的。hcg之后就不再升高。反而会逐渐的下降，月经又来了，恢复到非孕的状态。
生化妊娠由于没有形成胚胎，因此一般不会出现腹痛的症状，也不会排出什么明显的胚胎组织，最多有一些蜕膜组织。这是由于生化妊娠虽有受精卵，但是没有成功着床并未发育，因此在流血的时候也不会看见绒毛或孕囊等组织，其实和来月经没有什么区别，有的人可能出血比平时月经量多一些，对女性的子宫和身体都不会造成影响。一般不需要特殊处理。但是如果发生两次生化妊娠，就需要进行检查找出原因。
如果有停经之后激素（hcg）水平的升高，同时伴有下腹的剧痛，这种情况，不是要考虑生化妊娠，而是首先要考虑有宫外孕的可能性。